El club dijo en un comunicado que el desempeño del equipo en ese encuentro había sido "desastroso".
"Hasta nuevo aviso, los jugadores se manejarán por si mismos. La directiva le confía la responsabilidad del grupo a su capitán Gennaro Gattuso", indicó el club.
Gattuso se incorporó al Sion el año pasado, después de jugar 13 temporadas con el Milan.
Su primer partido como técnico será este miércoles, en el que el club enfrentará al Lausana por los cuartos de final de la Copa Suiza.
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El club dijo que no había despedido formalmente al español Muñoz, sino que el técnico había dado "un paso al costado".
Gattuso no tiene la licencia requerida para dirigir en Suiza, por lo que Muñoz sigue al frente en los papeles.
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Será el quinto técnico de Sion esta temporada. Muñoz había asumido en enero.
Sion marcha cuarto entre diez equipos en el campeonato suizo, aunque a nueve puntos del líder Grasshoppers.
Su carismático presidente Christian Constantin vio el segundo tiempo del partido del domingo en el banco, junto a Muñoz, y dijo que los jugadores no estaban acatando lo que les decía el técnico.
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