Al borde del descanso Matthieu Valbuena adelantó al equipo marsellés pero al inicio de la segunda parte Remy Cabella empató a un gol.
Andre-Pierre Gignac volvió a poner por delante a los visitantes aunque Morgan Sanson respondió con acierto para imponer un nuevo equilibrio, roto a un minuto del final por Dimitri Payet.
Los tres puntos sitúan al Marsella sexto en la tabla con los mismos puntos que el quinto, el Lyon, que recibe al Paris Saint Germain el domingo.
Resultados de la 33a. jornada:
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Montpellier 2 - Marsella 3
Sábado
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Lille - Valenciennes
Ajaccio - Burdeos
Evian TG - Bastia
Niza - Lorient
Rennes - Mónaco
Sochaux - Toulouse
Domingo
Nantes - Guingamp
Reims - Saint Etienne
Lyon - Paris Saint Germain